知网论文查重系统是国内知名的文献查重系统，支持的文件格式包括doc、docx、pdf等常见格式，同时也支持txt、rtf等文本格式文件。其中，doc和docx是最常见的Word文档格式，pdf为便携式文档格式，这些格式是学术论文常见的文件格式。在使用知网论文查重系统时，建议使用这些常见格式进行文献查重，以确保系统能够准确识别和比对您的论文内容。

此外，知网论文查重系统还支持一些其他少见的文件格式，如wps、odt等，但在使用这些格式时需要注意系统可能在识别和比对过程中出现一些兼容性问题。因此，为了确保文献查重的准确性和稳定性，建议尽量使用doc、docx、pdf等常见格式的文件进行查重。同时，在提交论文之前，还应仔细阅读系统的文件格式要求和注意事项，以避免因文件格式问题而影响到查重结果的准确性。